La Biblioteca de Investigación Juan de Córdova está ubicada en el Centro Cultural San Pablo en la histórica ciudad de Oaxaca y es una iniciativa de la Fundación Alfredo Harp Helú Oaxaca. Articula servicios y acervos académicos con proyectos culturales, sobre todo los que tienen como propósito promover las herencias culturales de Oaxaca y México. Además de ofrecer servicios bibliotecarios, sus actividades comprenden exposiciones, cursos, investigación académica y protección del patrimonio cultural.

La BIJC tiene como objetivos: localizar, evaluar, reunir, organizar, preservar y brindar acceso oportuno a los recursos informativos especializados en filología mesoamericana y ser un puente entre los pueblos y su historia.

Los materiales con los que cuenta son: libros, publicaciones periódicas, manuscritos, discos compactos, fotografías, partituras, mapas, películas y videos dedicados a la historia, cultura y lenguas, especialmente de Oaxaca y México. Su acervo resguarda algunas colecciones sobresalientes para los estudios históricos y culturales de Oaxaca, entre las que se encuentran la de Luis Castañeda Guzmán, John Paddock e Irmgard Weitlaner Johnson, pioneros de la historia y la antropología oaxaqueña; así como la de la biblioteca del Museo Textil de Oaxaca.

Esta biblioteca lleva el nombre de Juan de Córdova en honor al fraile que, en 1578, escribiera el Vocabulario en lengua zapoteca.